ich vermute mal dein Problem wird wahrscheinlich an folgendem liegen, sobald du Windows auf der SSD Installiert hast und den zweiten Datenträger mit ans Mainboard anschließt schaltet das UEFI BIOS auf die Bootpartition deiner Festplatte um oder in deinem UEFI BIOS ist noch der alte Pfad zu der Bootpartition auf der HDD eingetragen.
Dieses Verhalten kann ich nicht bestätigen.
Wenn man Windows10 bei ausgebauter 1. Festplatte (SSD) auf eine neue 2. HDD/SSD installiert, legt Win10 ein komplett neues Dateisystem an, das vom anderen Windows nichts weiß.
Baut man jetzt die 1. Festplatte wieder ein, kann man im
Bootmenü des BIOS auswählen, von welcher Festplatte/SSD man booten möchte - und nur dort!
Bei dieser Vorgehensweise wird
kein Windows-Bootmanager installiert.
Unter beiden Windows-Installationen sind dann alle Partitionen der jeweils anderen Installation sichtbar, das Laufwerk C: der anderen Installation bekommt im gebooteten Windows einen anderen Laufwerksbuchstaben zugewiesen (den kann man dann auch auf einen beliebigen freien Buchstaben umändern).
Von einer Installation zur anderen kommt man nur, wenn man die gerade gebootete Installation komplett herunterfährt (Falle Schnellstart beachten) und dann im BIOS-Bootmenü das Laufwerk der anderen Installation bootet.
Im BIOS-Bootmenü kann man in der Bootreihenfolge einstellen, welches Windows bevorzugt gestartet wird.
Das ist übrigens keine Theorie - genau so habe ich das an dem Rechner, an dem ich hier schreibe.